Peptidové substráty hrajú rozhodujúcu úlohu v rôznych oblastiach biochemického a biologického výskumu vrátane testov enzýmovej aktivity, objavovania liekov a proteomiky. Modifikácie peptidových substrátov sa často vykonávajú, aby sa zvýšila ich stabilita, špecifickosť a funkčnosť. Ako dodávateľ peptidových substrátov som v poriadku v bežných modifikáciách peptidových substrátov, ktoré budem v tomto blogu rozpracovať.
1. Chemické modifikácie na konci n -
N -terminál peptidu je jedným z najbežnejších miest na modifikáciu. Jednou z najjednoduchších a najbežnejších modifikácií je acetylácia. Acetylácia zahŕňa pridanie acetylovej skupiny do n -terminálnej aminoskupiny. Táto modifikácia má niekoľko výhod. Po prvé, môže chrániť peptid pred degradáciou aminopeptidázami, ktoré sú enzýmami, ktoré štiepia peptidy z N -konca. Napríklad v experimentoch bunkovej kultúry in vitro sú acetylované peptidové substráty stabilnejšie a môžu si zachovať svoju integritu dlhšie obdobie, čím zabezpečuje spoľahlivejšie experimentálne výsledky.
Ďalšou dôležitou modifikáciou N - terminálu je pridanie fluorescenčnej alebo chromogénnej skupiny. Fluorescenčné štítky, ako je fluoresceín izotiokyanát (FITC) alebo rodamín, môžu byť pripevnené k n -koncu. Tieto značené peptidy sa široko používajú pri testoch enzýmovej aktivity na báze fluorescencie. Keď enzým pôsobí na peptidový substrát, zmení sa fluorescenčný signál, čo umožňuje monitorovanie enzymatickej reakcie v reálnom čase. Napríklad v testoch proteázovej aktivity sa na meranie proteázovej aktivity detekciou zmeny intenzity fluorescencie v priebehu času môže použiť peptidový substrát označený FITC.
2. Chemické modifikácie na konci C -
Podobne ako N -terminál, C -koncový koncový peptid je tiež cieľom modifikácie. Amidácia je bežná modifikácia C - terminálu. Nahradením karboxylovej skupiny C -terminálu amídovou skupinou sa peptid stáva rezistentnejším na karboxypeptidázy, ktoré štiepia peptidy z koncového konca C. Amídované peptidy sú často stabilnejšie v biologických systémoch a môžu mať zlepšené farmakokinetické vlastnosti.
Okrem toho je možné C - terminál modifikovať rôznymi funkčnými skupinami pre konkrétne aplikácie. Napríklad pripojenie biotínovej skupiny na konci C - umožňuje ľahké čistenie a detekciu peptidu. Biotinylované peptidy sa môžu zachytiť pomocou guľôčok potiahnutých streptavidínom, čo je bežná technika v štúdiách interakcie proteín -peptid. To umožňuje výskumníkom izolovať a analyzovať interagujúce proteíny s vysokou špecifickosťou.
3. Bočné - úpravy reťazca
Bočné reťazce aminokyselín v peptidovom substráte sa môžu tiež modifikovať. Jednou z najznámejších modifikácií bočného reťazca je fosforylácia. Fosforylácia sa vyskytuje na hydroxylových skupinách zvyškov serínu, treonínu alebo tyrozínu. Fosforylované peptidy sú nevyhnutné na štúdium proteínkináz a fosfatáz. Proteínkinázy pridávajú fosfátové skupiny k špecifickým aminokyselinovým zvyškom v proteínoch, zatiaľ čo fosfatázy ich odstraňujú. Použitím fosforylovaných peptidových substrátov môžu vedci zmerať aktivitu týchto enzýmov a študovať signálne dráhy zapojené do procesov závislých od fosforylácie.
Ďalším typom modifikácie bočného reťazca je zavedenie neprirodzených aminokyselín. Neprirodzené aminokyseliny môžu mať jedinečné chemické a fyzikálne vlastnosti, ktoré sa nenachádzajú v prírodných aminokyselinách. Napríklad niektoré neprirodzené aminokyseliny sa môžu použiť na zavedenie špecifickej chemickej reaktivity alebo na napodobňovanie post - translačných modifikácií. Začlenenie neprirodzených aminokyselín do peptidových substrátov môže rozšíriť rozsah aplikácií a zlepšiť výkon peptidov v rôznych testoch.
4. Kríž - prepojenie úprav
Krížové prepojené modifikácie sa používajú na spojenie dvoch alebo viacerých peptidových molekúl spolu alebo na spojenie peptidu s inými molekulami, ako sú proteíny alebo nukleové kyseliny. Homobifunkčné krížky sa bežne používajú na prepojenie dvoch identických funkčných skupín na rôznych peptidoch alebo molekulách. Napríklad Disuccinimidyl Subberate (DSS) je homobifunkčný kríž, ktorý môže reagovať s primárnymi amínmi na peptidoch. Toto krížové prepojenie sa môže použiť na štúdium interakcií proteínov a peptidov alebo na vytvorenie polymérov na báze peptidu.
Na druhej strane heterobifunkčné kríženia majú dve rôzne reaktívne skupiny, čo umožňuje špecifické spojenie rôznych typov molekúl. Napríklad krížový linker s amínovou reaktívnou skupinou a sulfhydryl - reaktívna skupina sa môže použiť na spojenie peptidu s proteínom, ktorý má voľnú skupinu sulfhydrylovej skupiny. Krížové prepojenie modifikácií sa môže tiež použiť na vytvorenie peptidových konjugátov, ktoré majú potenciálne aplikácie pri dodávaní liečiva a cielenej terapii.
5. Príklady modifikovaných peptidových substrátov
Ponúkame širokú škálu modifikovaných peptidových substrátov. NapríkladMU-Val-HPH-FMKje peptidový substrát so špecifickými úpravami. Je navrhnutý na použitie v testoch kaspázy aktivity. Modifikácie v tomto peptidovom substráte zvyšujú jeho špecificitu voči kaspáz, čo umožňuje presné meranie aktivity kaspázy.
Z-Val-Phe-CHOje ďalší dôležitý peptidový substrát. Je to peptidový substrát inhibítora calpain. Modifikácie v tomto peptide z neho robia silný inhibítor Calpain, dôležitú proteázu zapojenú do mnohých fyziologických a patologických procesov. Použitím tohto peptidového substrátu môžu vedci študovať úlohu Calpain v rôznych biologických systémoch a rozvíjať potenciálne lieky zamerané na Calpain.
Inhibítor Calpain XIje tiež cenným produktom v našom katalógu. Má špecifické úpravy, vďaka ktorým je vysoko účinný inhibítor Calpain. Tento peptidový substrát sa môže použiť v štúdiách in vitro a in vivo na skúmanie funkcie Calpain a na vývoj terapeutických stratégií chorôb súvisiacich s Calpainom.
6. Dôležitosť modifikovaných peptidových substrátov vo výskume a priemysle
Modifikované peptidové substráty majú vo výskume aj priemysle veľký význam. Vo výskume sú to základné nástroje na štúdium funkcie enzýmov, interakcií proteínov a proteínov a signálnych dráh. Napríklad pri výskume rakoviny sa môžu modifikované peptidové substráty použiť na štúdium aktivity proteáz, ktoré sa podieľajú na invázii a metastázovaní nádorov. Pochopením úlohy týchto proteáz môžu vedci vyvinúť nové lieky proti rakovine.
Vo farmaceutickom priemysle sa pri objavovaní a vývoji liekov používajú modifikované peptidové substráty. Môžu byť použité ako olovené zlúčeniny na vývoj nových liekov alebo ako sond na skríning potenciálnych kandidátov na drogy. Napríklad modifikovaný peptidový substrát, ktorý môže špecificky inhibovať enzým súvisiaci s chorobou, môže byť ďalej optimalizovaný tak, aby sa vyvinul silnejší a selektívnejší liek.
7. Záver a výzva na konanie
Záverom možno povedať, že bežné modifikácie peptidových substrátov zahŕňajú N - terminál, C - terminál, bočný reťazec a krížové prepojenie úprav. Tieto úpravy zvyšujú stabilitu, špecifickosť a funkčnosť peptidových substrátov, vďaka čomu sú nevyhnutné nástroje v rôznych výskumných a priemyselných aplikáciách. Ako dodávateľ peptidových substrátov sa zaväzujeme poskytovať vysokokvalifikované peptidové substráty, ktoré uspokoja rôzne potreby našich zákazníkov.
Ak máte záujem o naše peptidové substráty alebo máte akékoľvek otázky týkajúce sa úprav peptidu, neváhajte nás kontaktovať a požiadajte o ďalšiu diskusiu a obstarávanie. Sme radi, že vám pomôžeme nájsť najvhodnejšie peptidové substráty pre vaše výskumné alebo priemyselné projekty.
Odkazy
- Creighton, TE (1993). Proteíny: štruktúry a molekulárne princípy. Wh Freeman and Company.
- Nelson, DL a Cox, MM (2008). Lehningerové princípy biochémie. Wh Freeman and Company.
- Walker, JM (2002). Príručka proteínových protokolov. Humana Press.