Po pochopení dôvodov nestability peptidov sa na základe dlhoročných skúseností v syntéze peptidov potvrdilo, že existujú nasledujúce riešenia na zlepšenie stability peptidov.
1) Miestne riadená mutácia
Nahradenie zvyškov, ktoré spôsobujú nestabilitu peptidu, alebo zavedenie zvyškov, ktoré zvyšujú stabilitu peptidu prostredníctvom genetického inžinierstva, môže zlepšiť stabilitu peptidu.
2) Chemická modifikácia
Existuje mnoho metód chemickej modifikácie peptidov, pričom modifikácia PEG je najviac študovaná. PEG je vo vode rozpustná polymérna zlúčenina, ktorá je biodegradovateľná a netoxická in vivo. PEG môže zlepšiť rozpustnosť peptidov po naviazaní, regulovať biokompatibilitu, zvýšiť tepelnú stabilitu, odolávať degradácii proteázy, znížiť antigenicitu a predĺžiť polčas in vivo. Výber vhodných metód modifikácie a kontrola stupňa modifikácie môže zlepšiť fyzickú zdatnosť alebo posilniť pôvodnú biologickú aktivitu.
3) Aditíva
Pridaním aditív, ako sú cukry, polyoly, želatína, aminokyseliny a určité soli, je možné zlepšiť stabilitu peptidov. Cukor a polyoly nútia viac molekúl vody obklopovať proteíny pri nízkych koncentráciách, čím zlepšujú stabilitu peptidov. Počas procesu lyofilizácie môžu vyššie uvedené látky tiež nahradiť vodu a vytvárať vodíkové väzby s peptidmi na stabilizáciu ich prirodzenej konformácie a môžu tiež zvýšiť teplotu skleného prechodu lyofilizovaných produktov. Okrem toho môžu povrchovo aktívne látky, ako sú SDS, Tween, Pluronic, zabrániť povrchovej adsorpcii, agregácii a zrážaniu peptidov.
4) Sušenie mrazom
Séria chemických reakcií, ktoré sa vyskytujú v peptidoch, ako je deamidácia, beta eliminácia, hydrolýza atď., vyžaduje účasť vody, ktorá môže slúžiť aj ako mobilná fáza pre iné reaktanty. Okrem toho môže zníženie obsahu vody zvýšiť denaturačnú teplotu peptidov. Preto môže lyofilizácia zlepšiť stabilitu peptidov.